Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbed3Q9D0L1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zbed3Q9D0L1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms