Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nde1Q9CZA6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms