Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ssbp2Q9CYZ8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp2Q9CYZ8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ssbp2Q9CYZ8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ssbp2Q9CYZ8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ssbp2Q9CYZ8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ssbp2Q9CYZ8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ssbp2Q9CYZ8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ssbp2Q9CYZ8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ssbp2Q9CYZ8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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