Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bud23Q9CY21 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bud23Q9CY21 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms