Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXY1

Tmem175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem175Q9CXY1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem175Q9CXY1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem175Q9CXY1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms