Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl11Q9CXW4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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