Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed5Q9CXE7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms