Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Xrcc3Q9CXE6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Xrcc3Q9CXE6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Xrcc3Q9CXE6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Xrcc3Q9CXE6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Xrcc3Q9CXE6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Xrcc3Q9CXE6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Xrcc3Q9CXE6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Xrcc3Q9CXE6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Xrcc3Q9CXE6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Xrcc3Q9CXE6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Xrcc3Q9CXE6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Xrcc3Q9CXE6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc3Q9CXE6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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