Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RpainQ9CWY9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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