Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufaf1Q9CWX2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf1Q9CWX2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms