Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn1Q9CWM4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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