Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms