Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snw1Q9CSN1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms