Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms