Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2Q9CQP2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms