Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms