Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rab5aQ9CQD1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rab5aQ9CQD1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rab5aQ9CQD1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rab5aQ9CQD1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rab5aQ9CQD1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rab5aQ9CQD1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rab5aQ9CQD1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab5aQ9CQD1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab5aQ9CQD1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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