Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NenfQ9CQ45 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms