Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms