Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg3Q9CPX6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg3Q9CPX6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms