Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GpnmbQ99P91 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms