Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brms1Q99N20 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brms1Q99N20 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms