Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac9Q99N13 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac9Q99N13 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms