Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PccbQ99MN9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PccbQ99MN9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms