Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp1b4Q99ME6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp1b4Q99ME6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms