Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nus1Q99LJ8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms