Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rsl24d1Q99L28 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsl24d1Q99L28 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms