Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q99KU6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q99KU6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q99KU6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q99KU6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q99KU6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q99KU6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q99KU6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q99KU6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q99KU6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q99KU6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q99KU6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q99KU6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q99KU6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q99KU6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q99KU6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q99KU6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q99KU6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q99KU6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q99KU6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q99KU6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q99KU6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q99KU6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q99KU6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q99KU6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q99KU6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q99KU6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Q99KU6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q99KU6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q99KU6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q99KU6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q99KU6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q99KU6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q99KU6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q99KU6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q99KU6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q99KU6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Q99KU6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q99KU6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q99KU6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q99KU6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q99KU6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q99KU6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Q99KU6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q99KU6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q99KU6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q99KU6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q99KU6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q99KU6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Q99KU6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q99KU6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q99KU6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q99KU6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q99KU6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q99KU6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q99KU6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Q99KU6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q99KU6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q99KU6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q99KU6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q99KU6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q99KU6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q99KU6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q99KU6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q99KU6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q99KU6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q99KU6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q99KU6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q99KU6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q99KU6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q99KU6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q99KU6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Q99KU6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q99KU6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q99KU6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q99KU6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q99KU6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q99KU6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q99KU6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q99KU6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q99KU6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q99KU6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q99KU6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q99KU6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q99KU6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q99KU6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q99KU6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q99KU6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q99KU6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q99KU6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q99KU6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q99KU6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q99KU6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q99KU6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q99KU6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q99KU6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q99KU6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q99KU6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q99KU6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q99KU6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms