Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms