Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lactb2Q99KR3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lactb2Q99KR3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms