Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlcd1Q99JT6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlcd1Q99JT6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms