Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms