Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pacsin3Q99JB8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pacsin3Q99JB8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms