Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd1Q99J36 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd1Q99J36 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd1Q99J36 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd1Q99J36 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd1Q99J36 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd1Q99J36 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd1Q99J36 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd1Q99J36 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd1Q99J36 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd1Q99J36 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd1Q99J36 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd1Q99J36 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thumpd1Q99J36 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms