Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms