Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prss28Q924N9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms