Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim59Q922Y2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim59Q922Y2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms