Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TardbpQ921F2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TardbpQ921F2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms