Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt16hQ920B9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt16hQ920B9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt16hQ920B9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt16hQ920B9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt16hQ920B9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt16hQ920B9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Supt16hQ920B9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Supt16hQ920B9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Supt16hQ920B9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Supt16hQ920B9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Supt16hQ920B9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Supt16hQ920B9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Supt16hQ920B9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Supt16hQ920B9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Supt16hQ920B9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Supt16hQ920B9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Supt16hQ920B9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Supt16hQ920B9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Supt16hQ920B9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Supt16hQ920B9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Supt16hQ920B9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Supt16hQ920B9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Supt16hQ920B9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Supt16hQ920B9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Supt16hQ920B9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Supt16hQ920B9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Supt16hQ920B9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms