Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ1

Rab29, Ras-related protein Rab-7L1, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab29Q91YQ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab29Q91YQ1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rab29Q91YQ1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rab29Q91YQ1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rab29Q91YQ1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rab29Q91YQ1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rab29Q91YQ1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rab29Q91YQ1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab29Q91YQ1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rab29Q91YQ1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms