Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcdhga12Q91XY7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcdhga12Q91XY7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms