Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q91WD4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q91WD4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q91WD4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q91WD4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q91WD4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q91WD4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q91WD4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q91WD4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q91WD4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q91WD4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q91WD4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q91WD4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q91WD4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q91WD4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Q91WD4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q91WD4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q91WD4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q91WD4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q91WD4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q91WD4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Q91WD4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q91WD4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q91WD4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q91WD4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q91WD4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q91WD4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q91WD4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q91WD4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q91WD4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q91WD4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q91WD4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q91WD4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Q91WD4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Q91WD4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q91WD4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q91WD4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q91WD4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q91WD4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q91WD4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q91WD4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q91WD4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q91WD4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q91WD4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q91WD4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q91WD4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q91WD4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q91WD4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q91WD4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q91WD4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q91WD4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q91WD4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q91WD4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q91WD4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q91WD4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q91WD4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q91WD4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q91WD4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q91WD4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q91WD4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q91WD4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q91WD4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q91WD4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q91WD4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q91WD4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q91WD4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q91WD4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q91WD4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q91WD4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q91WD4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q91WD4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q91WD4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q91WD4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q91WD4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q91WD4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q91WD4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q91WD4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q91WD4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q91WD4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q91WD4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q91WD4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q91WD4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q91WD4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q91WD4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q91WD4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q91WD4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q91WD4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Q91WD4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Q91WD4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Q91WD4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q91WD4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q91WD4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q91WD4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q91WD4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q91WD4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q91WD4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q91WD4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q91WD4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q91WD4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q91WD4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms