Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ApofQ91V80 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ApofQ91V80 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApofQ91V80 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms