Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crb1Q8VHS2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crb1Q8VHS2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crb1Q8VHS2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crb1Q8VHS2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crb1Q8VHS2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crb1Q8VHS2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crb1Q8VHS2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crb1Q8VHS2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crb1Q8VHS2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crb1Q8VHS2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crb1Q8VHS2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crb1Q8VHS2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crb1Q8VHS2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crb1Q8VHS2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Crb1Q8VHS2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Crb1Q8VHS2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crb1Q8VHS2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms