Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc3Q8VEM9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms