Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Cul7Q8VE73 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul7Q8VE73 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms