Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VCE4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VCE4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VCE4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms