Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rapgef3Q8VCC8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Rapgef3Q8VCC8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rapgef3Q8VCC8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms