Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W7

Agr3, Anterior gradient protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agr3Q8R3W7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Agr3Q8R3W7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Agr3Q8R3W7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Agr3Q8R3W7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Agr3Q8R3W7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Agr3Q8R3W7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Agr3Q8R3W7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Agr3Q8R3W7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Agr3Q8R3W7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Agr3Q8R3W7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Agr3Q8R3W7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Agr3Q8R3W7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Agr3Q8R3W7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms