Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CcsapQ8QZT2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CcsapQ8QZT2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CcsapQ8QZT2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CcsapQ8QZT2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CcsapQ8QZT2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CcsapQ8QZT2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CcsapQ8QZT2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CcsapQ8QZT2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms